Оказалось что сделать SSO для web доступа к 1С не так просто как казалось. В случае когда сервер 1С и Web-сервер(IIS прости господи) это разные…
Оказалось что просто настроить IIS на сквозную авторизацию не достаточно. Дополнительно необходимо включить SSO в конфиге сайта RDWeb: